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環狀RNA芯片定制檢測服務

環狀RNA芯片定制檢測服務

產品型號:

所屬分類:芯片定制及檢測實驗

產品時間:2022-05-18

簡要描述:收費標準/服務周期/提供結果:
歡迎咨詢詳談,我們會根據您的方案及需求制定詳細的服務協議。
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詳細說明:

環狀RNA芯片定制檢測服務

 

 

實驗技術簡介: 環狀RNA (ircRNA) 是區別于傳統線性RNA的一類新型RNA,具有閉合環狀結構,大量存在于真核轉錄組中。大部分的環狀RNA是由外顯子序列構成,在不同的物種中具有保守性,同時存在組織及不同發育階段的表達特異性。由于環狀RNA對核酸酶不敏感,所以比線性RNA更為穩定, 這使得環狀RNA在作為新型診斷標記物的開發應用上具有明顯優勢。近來研究顯示,環狀RNA在不同物種中起到miRNA海綿的作用,稱之為競爭性內源RNA (ceRNA) , 能競爭性結合miRNA。而與疾病關聯性miRNA的相互作用說明環狀RNA對疾病的調控起著非常重要的作用。

 

實驗操作流程:

1、樣品RNA抽提

2、RNA質量檢測

①使用Nanodrop測定RNA在分光光度計260nm、280nm和230nm的吸收值,以計算濃度并評估純度。

②用甲醛電泳試劑進行變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測RNA純度及完整性。

③提供RNA QC報告。

3、RNase R處理

4、cDNA/aRNA樣品合成和標記

5、標記效率質量檢測使用Nanodrop檢測熒光標記效率,標記效率合格以保證后續芯片實驗結果的可靠性。

6、芯片雜交

在標準條件下將標記好的探針和高密度基因組芯片進行雜交。

7、圖像采集和數據分析

使用GenePix 4000B芯月掃描儀掃描芯片的熒光強度,并將實驗結果轉換成數字型數據保存,使用配套軟件對原始數據進行分析運算。

8、提供實驗報告

①Scanning Image: Cy3熒光掃描圖像;

②Scatter Plot:散點圖,X軸為Control信號值,Y軸為Experiment信號值, 表示信號數據總體分布趨勢;

③Raw Data:探針的掃描熒光信號強度原始數據;

④Normalized Data:經過統計學方法標準化后數值;

⑤P-value: T-test統計分析顯著差異表達的基因,p-value越小, 該circRNA在兩組樣本間差異表達越顯著

⑥significant Up & Down Regulated CircRNA List:顯著差異表達的circRNA列表包含Fold Change, p-valuel以及circRNA的詳細注釋信息(相應的線性mRNA和miRNA結合位點)。

 

客戶提供:

1、實驗對象為組織樣品,取適量(50-100mg) 新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品,使用

BioPulverizer TM冰凍粉碎組織,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (Invitrogen) ,使用Mini-Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA。

2、實驗對象為細胞樣品,每份樣品取1x106~ 1x107細胞,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (樣品為貼壁細胞,每10cm2培養皿TRIzo1使用量為1ml),裂解后抽提RNA。

交付標準:

1、芯片檢測數據

2、完整的實驗操作規程、實驗報告(含軟件分析結果)以及實驗材料

 

實驗代做服務:

ELISA試劑盒免費代檢測

CCK8檢測

基因組DNA提取

 

蛋白相互作用分析

Western Blot

免疫組化

熒光定量PCR

動物模型服務

流式細胞檢測

ROS氧化分析

激光共聚焦

DNA甲基化實驗

細胞劃痕

鈣離子濃度檢測

掃描電鏡實驗

microRNA測序

動物實驗

探針合成

ATP/ADP檢測

石蠟/冰凍切片

定點突變

線粒體膜電位(MMP)檢測

細胞生長曲線的測定

藥理毒理動物實驗

 

免疫共沉淀

真核表達載體構建

染色質免疫沉淀CHIP

非標定量(Label-free)實驗



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